Das Franziskanische Institut für Spiritualität ist dem Pontificio Ateneo Antonianum, angeschlossen. Es bietet eine wissenschaftlich-akademische Ausbildung und eine praktische Anleitung für Studenten/innen, die sich auf eine Aufgabe als Dozenten, Erzieher oder Animatoren für Spiritualität vorbereiten. Das Institut versteht sich als ein Institut für den Gesamtbereich der Spiritualität (“Spirituelle Teologie”), wobei es allerdings der franziskanischen Spiritualität und benachbarten Fachgebieten besonderen Raum gibt. Das Institut ist in die Theologische Fakultät integriert und verleiht das Lizentiat und das Doktorat in Theologie mit der Spezifikation Spiritualität.

Der Grundkurs dauert zwei Jahre und ist in vier Semester aufgeteilt. Insgesamt sind es sechsundfünfzig Lektionen: zwölf Lektionen Allgemeine; achtunddreißig Lektionen Spezialgebiete, davon zweiundzwanzig Lektionen obligatorisch und sechzehn Lektionen Wahlfachkurse; vier Lektionen für Seminare und zwei Lektionen Methodologie.

Das Institut steht Priestern, Ordensmännern, Ordensfrauen und Laien offen, die die Bedingungen für den 2. Zyklus der Theologischen Fakultät erfüllen.